最新研究表明:龜類也可能是新冠病毒的潛在中間宿主

繼蝙蝠、穿山甲之後,2月26日,暨南大學吳建國課題組聯合湖北醫藥學院附屬人民醫院的劉龍在《journal of medical virology》發表文章稱,龜類(西部錦龜、綠海龜、中華鱉)也可能是將新冠病毒傳播給人類的潛在中間宿主。

(圖源:journal of medical virology



該項研究使用系統的比較和分析預測冠狀病毒刺突蛋白的受體結合域(RBD)與宿主受體血管緊張素轉換酶2(ACE2之間的相互作用,研究重點是比較新冠病毒(SARS-CoV-2)與SARS病毒、蝙蝠SARS樣CoV和其他冠狀病毒的刺突序列,從而有助於分析病毒的進化及尋找可能的病毒庫。此外,對ACE2結構和結合基序比對的分析,有助於提供線索來區分潛在宿主。


全球防控形勢嚴峻,病毒溯源至關重要

自2019年12月湖北武漢爆發不明原因肺炎疫情至2020年2月27日,據國家衛健委官網數據,新冠肺炎在中國已經造成78824例確診病例、2788例死亡病例;而在全球範圍內,據世界衛生組織統計,中國以外國家和地區已確診3664例,死亡57例。
 
世界衛生組織總幹事譚德塞博士在2月27日的媒體通報會上指出,過去两天,世界其它地區報告的新增病例數已經超過了中國的新增病例數。這種病毒具有大流行潛力,任何國家都不應僥倖以為本國不會有病例。


 (圖源:世界衛生組織官博)


而在國內,在經歷確診病例連續下降以後,26日,湖北以外30個省區市和新疆建設兵團新增確診病例出現反彈,從25日的5例增長到24例。
 
因此,不管是中國地區,還是全球範圍,新冠肺炎的防控形勢仍是緊張嚴峻的,病毒溯源工作的儘快推進,對揭示病毒來源及其進化規律,消除疫情源頭,防止疫情擴散都非常重要。
 
1月23日,中科院武漢病毒所石正麗團隊在bioRxiv預印版平台上發表文章《Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin》,提出
新型冠狀病毒或來源於蝙蝠。
 
2月7日,華南農業大學官方網站發布消息稱,華南農業大學、嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室沈永義教授、肖立華教授等科研人員聯合開展的最新研究表明,
穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主
。此後,2月18日,香港大學管軼團隊與廣西醫科大學胡艷玲課題組再次發表論文證明穿山甲很可能是新冠病毒從蝙蝠到人類的中間宿主。


(圖源:123RF)

 
此次湖北醫藥學院附屬人民醫院的劉龍聯合廣州暨南大學吳建國課題組的研究,則是新冠病毒溯源工作的又一項突破。
 

相比穿山甲,龜類在市場更為普遍

該項研究指出,新冠病毒編碼至少27種蛋白質,包括15種非結構蛋白、4種結構蛋白和8種輔助蛋白。刺突蛋白(S)是一種結構蛋白,位於病毒體的外殼上,負責與宿主受體血管緊張素轉換酶2(ACE2)結合。研究刺突蛋白中受體結合區域(RBD)序列的進化關係有助於理解病毒起源趨勢。
 
研究結果显示,蝙蝠SARS樣病毒 RaTG13與新冠病毒整體基因組具有96.2%的序列同一性。需要注意的是,
SARS病毒
穿山甲標本中分佈最廣的冠狀病毒。

(圖源:journal of medical virology



研究組通過比對來自SARS病毒、蝙蝠或穿山甲SARS樣病毒和新冠病毒的刺突蛋白的RBD序列,分析發現
新冠病毒RBD序列來自329-521部分與穿山甲SARS樣病毒 SRR10168377有93%的相似度,這要高於其與蝙蝠SARS樣病毒 RaTG13 89%的相似性。

(圖源:journal of medical virology

穿山甲SARS樣病毒 SRR10168377與蝙蝠SARS樣病毒 RaTG13隻有85%的同一性,如果只關注刺突RBD,穿山甲SARS樣病毒 SRR10168377更有可能越過物種屏障感染人類。

(圖源:journal of medical virology



從具有ACE2受體41和353位的RBD域中的Asn501來看,龜類和穿山甲似乎比蝙蝠更接近人類。
這表明龜類和穿山甲可能是新冠病毒的潛在中間宿主。
 
病毒受體結合序列和宿主受體的分析有助於快速鎖定新冠病毒可能的中間宿主。而與非法交易的穿山甲相比,市場上的龜類更普遍受歡迎。


中間宿主更多,溯源更為艱難

文章在最後討論部分指出,了解結構結合機制將有助於找到準確的病毒庫,並有助於制定預防對策。
據報道,新冠病毒刺突蛋白與宿主受體血管緊張素轉換酶2(ACE2)的結合能力比SARS病毒強得多。
這表明新冠病毒的中間宿主更多,短期內找到新冠病毒的中間宿主也很難。






目前已知龜類攜帶數十種病毒,
包括虹蛙病毒(RV)、尼多病毒(NV)、乳頭瘤病毒(PV)、甲魚虹彩病毒(STIV)、甲魚系統性敗血症球狀病毒(STSSSV)、龜細小核糖核酸病毒(ToPV)和中華鱉出血綜合征病毒(TSHSV),不能排除蝙蝠SARS樣CoV RaTG13或其他SARS樣病毒感染龜類,並在其進化後向人傳播。
 

從SARS病毒、MERS病毒到新冠病毒,皆指向蝙蝠是冠狀病毒的天然宿主,但中間宿主卻各不相同。此前研究表明,與其他動物相比,蛇因其同義密碼子相對使用度(RSCU)偏向,很有可能是新冠病毒的野生動物病毒庫。


該項研究提供的信息表明,與蛇和穿山甲一樣,龜類(西部錦龜、綠海龜、中華鱉)也可能是將新冠病毒傳播給人類的潛在中間宿主,但仍需進一步研究來確認。



總之,不管是之前非典事件中的果子狸,還是新冠肺炎中的蛇、穿山甲、龜類,食用野味都是一大陋習。在近日出台的全國人大常委會《決定》,
已確立了全面禁止食用野生動物的制度
,明確規定對涉及對野生動物違法犯罪行為要加重處罰,並對全面禁止以食用為目的的獵捕、交易、運輸陸生野生動物做出明確規定。



 
按照全國人大常委會最新公布的決定,凡是沒有列入畜禽遺傳資源目錄的陸生野生動物,一律禁止食用,不管是不是屬於重點保護的野生動物。但相關具體的名錄,還在進一步的完善和健全中。

 

編輯:春雨醫生

參考資料:

[1]Liu Z, Xiao X, Wei X, et.al, Composition and divergence of coronavirus spike proteins and host ACE2 receptors predict potential intermediate hosts of SARS‐CoV‐2. J Med Virol. Accepted Author Manuscript. doi:10.1002/jmv.25726

[2]國家衛健委,截至2月27日24時新型冠狀病毒肺炎疫情最新情況,2020-02-28,

http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqfkdt/202002/d5e15557ee534fcbb5aaa9301ea5235f.shtml

[3]中國政府網,國務院聯防聯控機制權威發布,2020-02-27,

http://www.gov.cn/xinwen/gwylflkjz34/wzsl.htm

 

 

版權聲明:本文為春雨醫生原創稿件,版權歸屬春雨醫生所有,未經授權禁止轉載,授權與合作事宜請聯繫reading@chunyu.me

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